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IT導入補助金2025でfreeeを導入できる!通常枠・インボイス枠の対象サービスを解説

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中小企業や個人事業主に幅広く取り入れられている、経営管理ソフト「freee」は、IT導入補助金の対象です。IT導入補助金を活用すれば、最大で対象経費の80%相当の補助を受けられます。

ただし、申請枠に応じて要件や補助率・補助額が異なるため、申請前にルールをしっかり確認しておくことが大切です。

本記事では、IT導入補助金でfreeeの申請方法や補助額、IT導入支援事業者の探し方も紹介します。IT導入補助金を活用してfreeeの導入を検討している事業者の方は、ぜひ参考にしてください。

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【2025年度】IT導入補助金とは?補助率や申請枠・変更点についても解説
 ・IT導入補助金2025のスケジュール 申請枠ごとの期限一覧
 ・IT導入補助金の賃上げ要件とは?達成できなかった場合どうなるか解説
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 ・【★本記事】:IT導入補助金2025でfreeeを導入できる!通常枠・インボイス枠の対象サービスを解説

この記事の目次

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freeeはIT導入補助金の通常枠とインボイス枠で補助対象になる

IT導入補助金では全部で4つの申請枠があり、freeeはその中で、「通常枠」と「インボイス枠(インボイス対応類型)」で補助対象になります。それぞれの申請枠は、活用目的や補助率・補助額が異なるため、自身の事業に合う枠を選ぶ必要があります。

通常枠とインボイス枠(インボイス対応類型)で申請できるfreeeのサービスは、それぞれ以下のとおりです。

申請枠freeeのサービス
通常枠freee人事労務
freee勤怠管理
freee工数管理
freeeサイン
freee経理
freee福利厚生
freee支出管理
freee請求書
freee業務委託管理
freee会計
freee販売
インボイス枠(インボイス対応類型)freee会計
freee販売
freee経理
freee支出管理
freee請求書

通常枠はfreeeの多くのサービスが対象となるのに対し、インボイス枠(インボイス対応類型)では会計や経理に関連するサービスのみが対象となります。そのため、会計や経理に関連するサービスを導入したい場合は、インボイス枠(インボイス対応類型)が最適です。

一方で、人事労務や勤務管理等に関するサービスを導入したい場合や、いくつかのサービスをまとめて導入したい場合は、通常枠を選ぶと良いでしょう。

なお、freeeはクラウド型サービスのため、通常枠とインボイス枠では原則2年分の費用が補助対象となります。ただし、IT導入支援事業者によっては初期導入費用が発生する場合があるため、その費用が補助対象に含まれるかを事前に確認しておきましょう。

通常枠はfreeeの多くのサービスが対象

IT導入補助金の通常枠は、様々な事業者の課題やニーズに合うITツールの導入を支援することで、労働生産性の向上をサポートする申請枠です。対象となるfreeeのサービスは、以下のとおりです。

・freee人事労務
・freee勤怠管理
・freee工数管理
・freeeサイン
・freee経理
・freee福利厚生
・freee支出管理
・freee請求書
・freee業務委託管理
・freee会計
・freee販売

通常枠の補助率は対象経費の1/2以内です。ただし、令和6年10月から令和7年9月の間で3か月以上、令和7年度改定後の最低賃金未満で雇用していた従業数が全体の30%以上であることを示した場合は2/3以内に引き上げられます。

補助額は、選択するプロセス数に応じて異なり、詳しくは以下のとおりです。

プロセス選択するプロセス数補助額
①顧客対応・販売支援
②決済・債権債務・資金回収管理
③供給・在庫・物流
④会計・財務・経営
⑤総務・人事・給与・教育訓練・法務・情シス・統合業務
⑥その他業種固有のプロセス
⑦汎用・自動化・分析ツール
1プロセス以上5万円以上150万円未満
4プロセス以上150万円以上450万円以下

要件となるプロセス数のうち、1プロセス以上を選択した場合は5万円以上150万円未満、4プロセス以上を選択した場合は150万円以上450万円以下となります。

一例として、freee人事労務を導入する場合は、「⑤総務・人事・給与・教育訓練・法務・情シス・統合業務」のプロセスに該当します。プロセス数は「1プロセス以上」となり、補助額は5万円以上150万円未満です。

一方で、freeeの異なるサービスや他のITツールをまとめて導入する場合、4プロセス以上に該当するため、補助額は150万円以上450万円以下となります。

なお、補助額150万円~450万円以下を申請する場合、賃上げ要件を満たすことが必須となります。賃上げ要件については、以下の記事で詳しく解説しているので、気になる方はご確認ください。

IT導入補助金の賃上げ要件とは?達成できなかった場合どうなるか解説

インボイス枠(インボイス対応類型)はfreeeの会計関連サービスが対象

インボイス枠(インボイス対応類型)はインボイス制度に対応した「会計」・「受発注」・「決済」の機能を有するITツールや、ハードウェア等の導入を支援する申請枠です。対象となるfreeeのサービスは、以下のとおりです。

・freee会計
・freee販売
・freee経理
・freee支出管理
・freee請求書

インボイス枠(インボイス対応類型)では、インボイス制度に対応するITツールが補助対象となるため、freeeの会計・受発注・決済に関するサービスが対象となります。また、ITツールを活用するために必要なハードウェア(パソコン・POSレジ等)が補助対象となる点も、通常枠とは異なる特徴です。

具体的な補助率・補助額は、以下のとおりです。

項目補助額補助率
ソフトウェア購入費・導入関連費~50万円3/4以内
(小規模事業者は4/5以内)
~350万円
※会計・受発注・決済のうち2機能以上選択が必要
2/3以内
パソコン・タブレット等~10万円1/2以内
レジ・券売機~20万円1/2以内

インボイス制度の導入を強力に支援する目的から、ソフトウェア購入費・導入関連費については、通常枠よりも高めに設定されています。また、50万円以下の部分については、中小企業は3/4以内、小規模事業者は4/5以内に引き上がります。

ただし、パソコン・タブレット等の導入に関しては補助率1/2以内・上限10万円まで、レジ・券売機に関しては補助率1/2以内・上限20万円までとなります。ソフトウェア購入費・導入関連費に比べ、ハードウェア類は補助率・補助額が下がる点に注意しましょう。

freeeに対応したIT導入支援事業者の探し方

IT導入補助金では、IT導入支援事業者と協力して対象のITツールを導入する必要があります。自分で直接購入しても、対象外になるため注意してください。

IT導入支援事業者は、以下の公式サイトから探せます。

▼IT導入補助金 ITツール・IT導入支援事業者検索
https://it-shien.smrj.go.jp/search/


出典:IT導入補助金 ITツール・IT導入支援事業者検索

「ITツールを探す」を選択し、「ツール名から探す」に導入したいサービス名(freee会計など)を入力、通常枠またはインボイス枠を選択して「検索」を押すと、対応するITツールとIT事業者を見られます。

IT導入補助金を申請する方法

IT導入補助金を申請する流れは、以下のとおりです。

①公式サイトや公募要領をよく確認する
②GビズIDプライムアカウントの作成
③SECURITY ACTION「一つ星」又は「二つ星」いずれかに宣言
④導入するツールを決め、IT導入支援事業者を選定
⑤IT導入支援事業者を通じて、IT導入補助金の交付申請をする
⑥交付が決定したら、補助事業を実施
⑦補助事業が完了したら、申請マイページより実績報告
⑧補助金額の決定・承認
⑨補助金受け取り後、あらかじめ決められた期間中に事業実施後の効果報告をする

IT導入補助金は、IT導入支援事業者から『申請マイページ』の招待を受け、申請者側が必要事項を記入して申請します。事前にGビズIDプライムアカウントの作成と、SECURITY ACTIONの宣言が必要です。

SECURITY ACTIONの宣言は完了までに1週間程度時間がかかるため、早めに手続きを済ませておきましょう。IT導入補助金のスケジュールや詳しい要件を知りたい方は、以下の記事も参考にしてください。

【2025年度】IT導入補助金とは?補助率や申請枠・変更点についても解説

個人事業主もIT導入補助金でfreeeを導入できる?

「個人事業主だけど、IT導入補助金を活用してfreeeを導入したい」と考えている方も多いかと思います。結論から言うと、法人だけでなく、個人事業主の方もIT導入補助金でfreeeを申請可能です。

ただし、開業して間もない事業者は注意が必要です。IT導入補助金の申請には、納税証明書や確定申告書の控え等の書類の提出が求められますが、開業して1年以内である場合、こういった書類が用意できません。書類を提出できることが要件となるため、確定申告を済ませてから申請しましょう。

なお、個人事業主の方が法人化した場合、コールセンターに相談が必要となることが公式サイトに記載されています。

参考:IT導入事業者2025 通常枠 よくある質問 No.50

まとめ

freeeは、事業の成長の後押しに大変有効なツールです。IT導入補助金を活用すれば初期費用の負担を軽減して導入できます。特にインボイス枠(インボイス対応類型)では、ソフトウェアだけでなくパソコンやPOSレジなども補助対象となるため、経営の強化に大きく役立ちます。

ただし、申請枠ごとに対象となるサービスや補助内容が異なるため、自社の目的や状況に合った枠を選ぶことが大切です。個人事業主の方も申請可能ですが、納税証明書や確定申告書の控えなど必要書類の提出が求められる点には注意してください。

申請期限やスケジュールは年度ごとに変わるため、最新情報を確認してから申請しましょう。

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